本報(bào)訊（記者張行勇）西北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院教授嚴(yán)健、張亮、陳居明帶領(lǐng)的西北大學(xué)與香港城市大學(xué)聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)，成功開發(fā)了一種檢測(cè)活細(xì)胞內(nèi)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的新技術(shù)，并取名為CARPID ，可助力非編碼RNA研究。相關(guān)研究成果近日在線發(fā)表于《自然—方法》。

長(zhǎng)鏈非編碼核糖核酸（lncRNA）被認(rèn)為是基因組中的主要“暗物質(zhì)”。目前生物醫(yī)學(xué)界越來越多的研究表明，這些RNA分子可能參與細(xì)胞內(nèi)一系列重要的生理活動(dòng)，與腫瘤發(fā)生發(fā)展也有著密切關(guān)系，如DNA突變引起腫瘤的發(fā)生。而DNA突變可能會(huì)改變相關(guān)蛋白質(zhì)的序列和功能，如造成信使RNA序列的改變等。

據(jù)團(tuán)隊(duì)相關(guān)專家介紹，相較于以往的方法，CARPID的優(yōu)勢(shì)在于它不需要經(jīng)過預(yù)先的小分子或者高能紫外線的交聯(lián)，而是在生理?xiàng)l件下檢測(cè)活細(xì)胞的lncRNA與蛋白質(zhì)相互作用，可以有效避免交聯(lián)所產(chǎn)生的系統(tǒng)性誤差。此外，由于其他方法幾乎都需要設(shè)計(jì)多個(gè)RNA探針來富集目標(biāo)lncRNA，對(duì)于細(xì)胞中含量比較低或者長(zhǎng)度比較短的lncRNA技術(shù)難度較大。

CARPID大大提高了方法的敏感性，也相對(duì)簡(jiǎn)便。該技術(shù)具有廣泛的應(yīng)用前景，包括尋找在腫瘤發(fā)生過程中具有重要作用的RNA結(jié)合蛋白，以及用于發(fā)現(xiàn)新冠病毒RNA基因組侵入人體細(xì)胞后的重要結(jié)合蛋白，這些蛋白分子或許可以作為治療相關(guān)疾病的藥物靶點(diǎn)。

相關(guān)論文信息：https://doi.org/10.1038/s41592-020-0866-0

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